uORFlight

Option 2--uORF variation in accessions

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Aromatic (basmati/sandri type)
CX104
CX110
CX112
CX143
CX149

Aus
CX368
B049
B164
B221
B243
CX37
CX108

Aus/boro
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Option 3--altered uORF type attribute Please check change and group to search genes with altered uORF type attribute. Gene families infomation source: 1. Kinase subfamilies: Wang Y., Liu Z., Cheng H., et al. (2014) Nucleic Acids Res., 42, D496. 2. NLR: Sarris P. F., Cevik V., Dagdas G., et al. (2016) BMC Biol., 14, 8. 3. TF: Jin J., Tian F., Yang D., et al. (2017) Nucleic Acids Res., 45, D1040.
Gene family	Kinase subfamilies	Check/Uncheck All CAMK: CAMKL CAMK_Unique CAMK1 TKL: TKL_Unique IRAK MLK CMGC: MAPK CDK GSK DYRK CMGC_Unique CLK RCK Other: Other_Unique WEE Haspin SCY WNK ULK NEK TTK IRE BUB Aur NAK PEK CDC7 VPS15 TLK Bud32 CAMKK AGC: NDR AGC_Unique MAST PKA PDK1 CK1: CK1 CK1_Unique STE: STE_Unique STE11 STE20 STE7 Atypical: ABC1 TAF1 PIKK G11 RIO PDHK TK: TK_Unique
	NLR	Check/Uncheck All
	TF	Check/Uncheck All NAC B3 MYB_related ERF bHLH C3H M-type_MADS C2H2 SBP bZIP HD-ZIP DBB MYB LBD GRAS Dof NF-YC GATA YABBY NF-YB NF-X1 FAR1 GeBP RAV G2-like Trihelix WRKY Whirly ZF-HD BBR-BPC AP2 STAT NF-YA Nin-like ARF BES1 TALE SRS WOX MIKC_MADS CO-like HB-other VOZ TCP HSF LSD E2F/DP ARR-B CAMTA EIL GRF CPP S1Fa-like HB-PHD HRT-like NZZ/SPL SAP LFY
	All	Check/Uncheck All
Group		among Rice accessions using all gene models among Rice accessions using the representative gene model among gene models in Rice Nipponbare
Change		Type1-only and Type2 Type1-only and uORF-Free Type2 and uORF-Free

Option 1--uORF variation in genes

Option 2--uORF variation in accessions

Option 3--altered uORF type attribute